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“RNA魔剪”新成員“面紗”揭開 定位病變細胞更精准
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作者:
admin
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2019-7-26 19:41
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“RNA魔剪”新成員“面紗”揭開 定位病變細胞更精准
CRISPR-Cas13系統能夠靶向編輯RNA,被稱為“RNA魔剪”。隨著科學家們钻研的深刻,其家属成員不斷壯大。近日,發表在《天然·通訊》的一項功效,揭開了“RNA魔剪”家属最年輕成員“CRISPR-Cas13d”的神秘面紗。
這項功效來自福建師范大學歐陽鬆應传授團隊。該團隊解析了瘤胃球菌的Cas13d卵白(簡稱UrCas13d)與crRNA二元復合物高辨别率晶體結構,揭露了UrCas13d加工前體crRNA的酶活性關鍵位點,鑒定了crRNA的間隔序列和靶向RNA之間的錯配耐受性等以前还没有钻研清晰的問題。
“這就像飛機設計工程師獲患了設計並制造一架飛機的圖紙與工序,為补缀或設計出更超卓的飛機供给了藍圖。”歐陽鬆應暗示,這為進一步革新Cas13d作為核酸編輯及檢測东西,並發揮其在解決人類疾病與康健等問題上的應用潛力,供给了扎實的結構基礎和理論依據。
“RNA魔剪”應用潛力庞大
CRISPR-Cas系統是一種原核生物(細菌和古細菌)的免疫防御系統,該系統表達的非編碼RNA(crRNA)及其相關Cas卵白組成的復合物,使得原核生物能夠識別並且“撕碎”入侵噬菌體的核酸物質(DNA或RNA),用以连结本身遺傳物質的“純潔”,在原核生物的進化中起到首要感化。
“恰是由於這種精確地靶向切割特定核酸序列的功效,CRISPR-Cas系統被開發成高效的基因編輯东西,可以對遺傳物質DNA或RNA,進行依賴核酸序列信息的精確識別和切割。”歐陽鬆應說,此中名聲在外的CRISPR-Cas9系統可以高效地編輯DNA序列,用於糾正個體細胞內的基因缺点,給眾多遺傳疾病和罕見病治療帶來了但愿,該系統已經從實驗室钻研階段進入到臨床钻研階段,具备治愈或預防多種人類疾病的潛力。
比年來,源於生物學钻研及醫學領域的庞大應用潛力,一類可以特異地靶向檢測與編輯RNA的CRISPR-Cas系統被發現並報道出來,定名為Cas13(包含了a、b、c、d四個家属成員)系統。這一針對RNA的編輯东西可以在RNA程度調節基因的功效,而不會對基因自己造成永恒性改變。
2018年4月,美國索爾克钻研所一個課題組和美國Arbor生物技術公司的課題組分別報道了通過生物信息學法子篩選,並經過功效實驗驗証的新型Cas卵白,定名為Cas13d。作為最年輕的成員,Cas13d與其他“兄弟姐妹”在功效上有著类似之處,但更有其獨特之處。
“關鍵在於巨细。”歐陽鬆應介紹,Cas13d的卵白序列長度約為930個氨基酸,比其他Cas13家属成員明顯偏小,比Cas9更是小33%,這種尺寸使其更易包裝到容量較小的載體中,如腺相關病毒(AAV)載體,是以在開發新藥、新质料和新的診斷法子上具备廣泛應用潛力。
獲得新型“魔剪”高辨别率晶體結構
結構生物學是份子生物學、生物化學及生物物理學的分支學科,關心的是生物大份子(比方卵白質份子和核酸份子)的份子三維結構(包含構架和形態),獲得它們的結構信息,並钻研生物大份子的結構與功效之間的關系。
“所有的生命活動都是通過各種生物大份子的互相感化來實現,而結構生物學能夠解釋生物大份子的構象和互相感化的方法,從原子程度揭露生命過程的詳細機制,令人們‘知其但是知其以是然’。”歐陽鬆應告訴記者,今朝結構生物學的钻研范圍已經触及到大多數首要的生命活動,份子生物學的每個前沿冲破都與結構生物學紧密亲密相關。
在本钻研中,歐陽鬆應課題組將結構生物學與生命科學前沿钻研課題結合,解析了UrCas13d卵白和crRNA二元復合物的高辨别率晶體結構,可以直觀看到每個原子的位置及它們之間的互相感化細節信息。
“當入侵者到來,CRISPR-Cas系統會在‘指揮官’(前導序列)的調控下轉錄出兩種‘防御质料’,此中一種就是前體crRN
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,A,另外一種是我們钻研的Cas卵白。”歐陽鬆應比方說。這一钻研清晰地解釋了Cas13d這把“新型魔剪”,事实採用了什麼樣的空間結構结构來加工前體crRNA,並若何結合成熟的crRNA,构成具备識別靶向RNA能力的功效復合物,從而進一步钻研清晰該卵白具备的crRNA依賴的RNase活性的份子機理。
相關钻研表白,Cas13d可做為一種強大RNA編輯东西,用於糾正老年痴呆症患者細胞中引发疾病的卵白質失衡。同時,Cas13d可以作為一種可操控的RNA結合模
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, 塊,有用靶向細胞內的RNA轉錄物,為轉錄組工程和疾病治療供给了一個通用平台。
“該钻研揭開了CRISPR-Cas13d系統的神秘面紗,對其技術機制特點有了更深入理解,有助於這項技術更廣泛地應用,從而造
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,福人類。”歐陽鬆應說。(謝開飛)
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